Tento okruh bol pôvodne navrhnutý ako 4km (2,5 míle) dlhá trať s dvoma klopenými zákrutami, tzv. superspeedway (ako je dnešný okruh v Daytone), ale kvôli nedostatku financií tento projekt nemohol byť dokončený, avšak jedna klopená zákruta už bola postavená. Prestavaný okruh, ktorého súčasťou bola táto klopená zákruta, bol otvorený v decembri roku 1965. Ukázalo sa však, že je akosi nebezpečný a to hlavne vďaka svojej klopenej zákrute, v ktorej dochádzalo k mnohým nehodám. Pozdejšie bola trať prebudovaná a tento problém bol vyriešený.
Na konci sezóny 1976 sa tu išli prvé preteky formuly 1 v Japonsku a zároveň to bol posledný pretek tejto nehodami poznačenej sezóny. Závod mal dramatickú zápletku v podobe súboja o titul majstra sveta medzi Jamesom Huntom a Nikim Laudom. Na trati panovali nebezpečné podmienky v podobe dažďových prívalov, vďaka ktorým sa prakticky rozhodlo o titule majstra sveta, ktorý získal James Hunt. Závod vyhral Mario Andretti na Lotuse, s náskokom jedného kola na druhého v poradí. James Hunt skončil na treťom mieste a Niki Lauda, ktorému by stačilo skončiť na piatom mieste, preteky vzdal už v druhom kole, práve kvôli nebezpečným poveternostným podmienkam. O tom ako tesne to dopadlo svedčí aj to, že ešte 2 kolá pred koncom sa Hunt nachádzal na 5. mieste, teda titul by o 1 bod získal Lauda. Neskôr sa Lauda vyjadril slovami, "môj život je oveľa cennejší než titul", dodnes je to považované za jeden z najhrdinskejších činov v histórii F1. V ďalšej sezóne už nebolo toľko dôvodu k oslavám, a to kvôli havárii Gillesa Villeneuva s Ronniem Petersonom, ktorá stála život fotografa a traťového maršála. O desať rokov neskôr sa formula 1 na japonské ostrovy vrátila, ale už nie na Fuji, ale na novú trať v Suzuke.
Fuji však zostala i naďalej populárna vďaka pretekom športových áut a boli tu usporiadané rôzne japonské národné preteky. Postupom času sa trať stala príliš rýchlou a tiež trochu nebezpečnou, z tohto dôvodu boli na okruhu vybudované dve spomalovacie šikany. Jedna hneď za prvou ostrou zákrutou, druhá na začiatku veľmi dlhej a rýchlej poslednej zákruty prezývanej 300R. Hlavná dominanta trate, takmer 1,5km dlhá cieľová rovinka, bola zachovaná.
Na jeseň roku 2000 kúpila trať spoločnosť Toyota. O 3 roky neskôr bola trať uzavretá a prestavaná podla návrhov Hermanna Tilkeho. Trať bola znovu otvorená 10. apríla 2005. Formula 1 sa tu vrátila v sezóne 2007, preteky však sprevádzali škandály, po tom ako usporiadatelia nezvládli prepravu divákov, a tí od nich napokon vysúdili obrovské peniaze. Inak preteky to boli opäť rozmáčané, štartovalo sa za bezpečnostným vozidlom, a to opustilo trať až po 19 kolách. Vyhral Lewis Hamilton a 2 preteky pred koncom sezóny, tak zvýšil vedenie v priebežnom poradí na 12 bodov, napokon to však aj tak neuhral a majstrom sa stal Kimi Raikkönen. O rok už v pretekoch bez škandálov, vyhral Fernando Alonso. Od roku 2009 sa mala VC Japonska striedať medzi Suzukou a Fuji, ale pod vplyvom novej ekonomickej krízy sa Fuji usporiadania vzdalo v prospech Suzuky.